私はマグネットBを付けたベースが上の黒線スイッチにさわる恐れがありそうで削ったのですが、どうやらこの位置ではなく もう少し手前で止まっているようですね。時間切れタイマーかも？リモコンボタンTB2-3を押してから発射台が下がって２号後退止まるまでが合計10秒くらいでしょうか？

Kankoba様
アドバイス感謝いたします。
バラシと組み立てを繰り返すうち、マグネットBベース（丸）とリミットスイッチが
接触して動きが止まる事象が発生して、自分もkankobaさんの写真のように
マグネットBベースを削って加工しております。
結論から言いますと、正常に動作するようになりました。
自分のようにまだ製作中の方もいると思いますので、修正過程だけ書いておきます。
当初リミットスイッチの不具合かスイッチへの何かの接触による動きの停止を疑い、スイッチの交換等いろいろやりましたが改善せず、2号を乗せない状態だと正常に動作することから基盤不良は無いと考え、マグネットベース（丸・四角）が何かに接触して動きが止まると仮定して、まず写真①の発射台裏の赤丸部分をヤスリがけしたところ、正常動作したので
ヤッターと思ったのですが、もう一度やると、やはり同じ位置で止まってしまいました。
この時発射台ベースをいろいろと角度を変え、ベルトと滑走路の状況を見たところ、四角いマグネットベースが写真②の矢印の発射台ベース噴射シールドのエッジ部分で止まって
いるのが見えました。原因が判れば、あとは対策です。バラしたところエッジ部分にわずかなバリがあることが判明、早速岩盤方向へヤスリがけしてツルツル状態に仕上げたところ
問題なく動作するようになりました。2号の動きをスムースにするために滑走路表面をツルツルにしていましたがマグネットが接触する裏面をツルツルにする方が重要でした。
エッジ部分を削りすぎて若干2号の動きにムラが発生しますが、当初より動きはスムースになりました。自分は発生していませんが、マグネットの剥がれも裏面のデコボコとマグネットの接触が関係しているかもしれません。ただ今回の解決に至るまで3週間近くかかり、その間バラシと組み立てを十数回したため、部品がどんどん痛んでいき、交換を余儀なくされました。（自分は補給パーツ用に103から110まで購入していたので、即交換できましたが、いろいろ部品を使用してしまったため、104から107まで再購入しました）
最後にkakoba様のいろいろな箇所の電動化にはいつも感心しています、自分にはハードルが高くなかなか真似できませんが、これなかも電動化楽しみにしています。
長文になり失礼しました。

滑走路裏面は噴射シールドのあたりがキモみたいですね。（削りすぎも良く無いようで…写真）なおってよかったです。私もさらに補修用予備パーツ買い足そうっと…（そろそろ在庫処分バーゲンセールで安くなったりはしないかな？）