私も模型初心者で確かなことは言えず、参考になるかどうかわかりませんが、
①私も最初電源を入れた時、いきなり閉じていたプールが開きました。投稿してアドバイスを求めたところ、
電源を入れると最初に原点復帰動作が始まるトのことで、プールは閉じる、リフトは下がる、搬送台車は格納庫に、が原点でそれ以外のところにある場合は全て原点に戻る動作が始まり、元々原点にあれば、何も動かないそうです。私の場合は、モーターの極性が標準のモーターと逆になっていた為、開閉判断が逆転していました。対策は、モーターの赤と白のリード線を逆付けしました。原因は元々モーターの配線が逆付けの場合か、もしくは、断線等で市販のコネクタに付け替えた時に逆になる場合があるそうです。
②説明書にも椰子の木2番目と3番目の間と書いてありますが、私の個人的な意見としては、そこは絶対に違うと思います。おそらく2号の頭（黄色いラインのところ)が滑走路と岩板扉のカバーの境目よりちょっと前ぐらい（長方形のマグネットもちょうどその真下ぐらいにある）の所だと思います。椰子の木2～3番目だと本来2号の頭を誘導するはずの長方形のマグネットが2号のお尻を誘導してしまい、傾斜滑走路から半分身を乗り出すところまでいってしまします。

貴重なアドバイス、ありがとうございます。
とりあえず、1号から解体頑張ります。
m(_ _)m