謎ですよね、、、海面の四角い穴と併せて3か所の謎の開口とふさぎパーツ。
小生は前に紹介の通り、海の部分は海中ののぞき穴とし、もう一つの山頂部分は、2号格納庫を見るのぞき穴とすることにしました。中に照明をつけて格納庫の屋根を見せる予定です。

私も、はっきりとはわかりませんが、97号のパーツの時に冊子で「成形時に空いた穴を埋めるためのパーツ」と説明されているので、私の想像としては、おそらくココが樹脂射出成形型の樹脂注入のゲートになっているのではと思います。相当デカいゲートのようでそのままではごついバリが残り、平面仕上げが必要となるためゲートの跡をそっくり切り取って別パーツをはめ込むことにより、手仕上げ作業をなくすようにしたのではないでしょうか。プラモデルの成形型の様に多くにパーツをレイアウトして一気に射出成形するので、たまたまゲートに当たったパーツがこのような形になったのでは。私の勝手な推測です。
モデラーのプラモデルにくわしい方ならもっとわかりやすく説明できるのではと思います。

おそらくスストシさんの推測が正解ですね。四角い穴にゲートがあります。私も接着せずにマグネットつけてのぞき穴にしようと…あまりいいところがのぞけない？　山を外すとき指を突っ込むと便利(^_^）